ต้องเริ่มการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะที่เหมาะสมโดยเร็วที่สุด ควรทำการเจาะเอวก่อน เนื่องจากยาปฏิชีวนะจะทำให้แบคทีเรียจากน้ำไขสันหลังเติบโตได้ยากขึ้น อย่างไรก็ตาม การเก็บตัวอย่างเลือดยังสามารถช่วยในการระบุสาเหตุและลำดับความสำคัญคือการเริ่มการรักษาโดยไม่ชักช้า ยาปฏิชีวนะหลายชนิดใช้รักษาโรคเยื่อหุ้ม สมอง อักเสบ ได้แก่ เพนิซิลลิน แอมพิซิลลิน และเซฟไตรอะโซน ระหว่างการแพร่ระบาดของเยื่อหุ้มสมองอักเสบจากไข้กาฬหลังแอ่นและนิวโมคอคคัส ยา ceftriaxone เป็นยาที่เลือกใช้