ในปี พ.ศ. 2555 มีการค้นพบไวรัสโคโรนาอีกชนิดหนึ่งที่สามารถก่อให้เกิดโรคทางเดินหายใจเฉียบพลันรุนแรงซึ่งต่อมารู้จักกันในชื่อโรคระบบทางเดินหายใจตะวันออกกลาง (MERS) ในมนุษย์ ผู้ติดเชื้อรายแรกพบในซาอุดีอาระเบีย และมีรายงานรายอื่นๆ ไวรัสโคโรนา ในปีถัดมาในฝรั่งเศส เยอรมนี จอร์แดน กาตาร์ ตูนิเซีย สหรัฐอาหรับเอมิเรตส์ และสหราชอาณาจักร กรณีที่ได้รับการยืนยันทั้งหมดมีความเชื่อมโยงโดยตรงหรือโดยอ้อมกับตะวันออกกลาง จากกรณียืนยันทั้งหมดที่บันทึกไว้ในปี 2562 ประมาณหนึ่งในสามจบลงด้วยการเสียชีวิต ไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่ MERS มีความคล้ายคลึงกับไวรัสโคโรนาสายพันธุ์อื่น ๆ ที่ทราบว่ามีต้นกำเนิดในค้างคาว และคิดว่าน่าจะส่งต่อจากค้างคาวไปยังสัตว์อื่น ๆ ก่อนที่จะส่งต่อไปยังมนุษย์ อูฐถูกระบุว่าเป็นแหล่งกักเก็บไวรัสเมอร์ส