พวกเขาเกือบถูกกวาดล้าง ผู้รอดชีวิตไม่กี่คน รวมทั้งเชกูวาราที่ได้รับบาดเจ็บ ไปถึงเซียร์รา มาเอสตราที่ซึ่งพวกเขากลายเป็นศูนย์กลางของกองทัพกองโจร ฝ่ายกบฏค่อยๆ เพิ่มกำลัง ยึดอาวุธจากกองกำลังของบาติสตา ได้รับการสนับสนุนและเกณฑ์ทหารใหม่ ในตอนแรก เช เกวารา เกวาราเข้ามาเป็นแพทย์ของกองกำลัง แต่เขาได้รับการฝึกฝนการใช้อาวุธด้วย และเขากลายเป็นหนึ่งในผู้ช่วยที่คาสโตรไว้วางใจมากที่สุด อันที่จริง เชกูวาราที่ซับซ้อน แม้จะได้รับการฝึกฝนให้เป็นผู้รักษา แต่บางครั้งก็ทำหน้าที่เป็นเพชฌฆาต (หรือสั่งให้ประหารชีวิต) ผู้ต้องสงสัยว่าเป็นผู้ทรยศและผู้หลบหนี เขาบันทึกช่วงเวลาสองปีที่ใช้ในการโค่นล้มรัฐบาลของบาติสตาในPasajes de la guerra revolucionaria (1963;ความทรงจำของสงครามปฏิวัติคิวบา , 2511).